Si ma ammesso che Madara possa percepire il chakra non è che la portata della sua abilità si estenda su tutta la terra! Non è come Goku che percepiva le aure pure su pianeti distanti.
Avrà certamente una portata limitata (Naruto quando non sente il chakra di Kakashi, chiede se sia in missione, quindi fuori dal raggio di azione della sua percezione).
Perciò pur non conoscendo dove sia localizzato il nascondiglio di Madara dubito sia giusto dietro l’isola e abbia la possibilità di percepire il chakra di Kisame.