Kaede Shiranui è una ragazza appartenente ad una famiglia agiata giapponese, con l'unico difetto forse di essere troppo sensibile ai problemi altrui.
Un giorno come tanti Kaede si ritrova in camera un'altra ragazza intenta a rubarle della biancheria intima.
Ella si presenta col nome di Shinobu, e racconta a Kaede che, per superare l'esame d'apprendista ninja, era necessario rubare della biancheria da alcuni abitanti del vicinato.
Kaede, provando pietà per la ragazza, decide comunque di donarle un capo d'abbigliamento per permetterle di superare l'esame.
Da quel giorno in poi, Shinobu non si staccherà piu da Kaede, e quest'ultima conoscerà dal vivo la scuola segreta di ninja, dove sembra che nessuno abbia un minimo di cervello.
Il primo fra tutti è proprio l'insegante di Shinobu, Onsokumaru, una strana palla gialla, pervertito come pochi che, con Sasuke, un altro ninja della scuola, tenta in ogni modo di denudare le due.
A tenerli a bada però ci penserà Miyabi, sorella minore di Shinobu, la quale, anche se più piccola, è molto più sveglia della sorella.